Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim44Q9QXA7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim44Q9QXA7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim44Q9QXA7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim44Q9QXA7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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