Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms