Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms