Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms