Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rabgef1Q9JM13 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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