Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tcf23Q9JLR5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms