Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms