Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms