Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pgpep1Q9ESW8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms