Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms