Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnn1Q9EQR3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms