Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmgn3Q9DCB1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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