Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45286-201ENSMUST00000209267 1350 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm37893-201ENSMUST00000192826 2437 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Lcn2-201ENSMUST00000050785 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms