Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim23Q9DAL0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim23Q9DAL0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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