Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms