Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms