Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Snx5Q9D8U8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Snx5Q9D8U8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Snx5Q9D8U8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx5Q9D8U8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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