Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl4Q9D8E6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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