Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Tmigd1Q9D7L8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Tmigd1Q9D7L8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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