Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms