Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chmp4cQ9D7F7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp4cQ9D7F7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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