Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp19Q9D7A6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms