Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfn4Q9D6I3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms