Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc81Q9D5W4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc81Q9D5W4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms