Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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