Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms