Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms