Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrs1Q9CYH6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms