Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpusd4Q9CWX4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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