Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd12Q9CWU0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms