Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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