Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdca4Q9CWM2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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