Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms