Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms