Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms