Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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