Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms