Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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