Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms