Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b1Q99NB9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b1Q99NB9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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