Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Ms4a4dQ99N05 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ms4a4dQ99N05 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ms4a4dQ99N05 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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