Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtprtQ99M80 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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