Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms