Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms