Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ophn1Q99J31 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms