Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms