Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Nek8Q91ZR4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nek8Q91ZR4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nek8Q91ZR4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nek8Q91ZR4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nek8Q91ZR4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nek8Q91ZR4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nek8Q91ZR4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nek8Q91ZR4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek8Q91ZR4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms