Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klc3Q91W40 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms