Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rprd1aQ8VDS4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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