Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh10Q8VCH7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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